实验室按照“公平竞争、择优支持”的原则，设立开放课题。目前部分课题取得了阶段性研究成果：有关“高山植物起源和适应性进化”项目旨在针对全球范围内典型高海拔地区（亚洲喜马拉雅山、欧洲阿尔卑斯山、美洲安第斯山和非洲乞力马扎罗山）的高山植物开展适应性和物种形成研究，通过对不同地区高山植物的比较研究，揭示高山植物的起源、多样化式样和机制。目前该课题已完善了相关物种的基本生物学等信息，完成了10 个研究背景清楚、分布于不同海拔的代表性类群的全基因组测序和组装。结合全长转录组、非编码RNA、small RNA 等转录组测序，已完成4 个物种基因组的注释及相关分析。探讨了基因组维持机制；澄清了基因家族扩张模式，全面解析了各重要基因家族（如R 基因基因家族）的特征；澄清了内含子长度变异机制。借助于群体基因组学和进化生物学方法，揭示了类群的群体遗传结构及其影响因素，鉴定了与高山植物适应相关的基因和代谢途径。